Pencetus Lockdown Ungkap Kenapa Virus Corona Lebih Mematikan di Eropa dan Amerika daripada di China

Eropa dan Amerika Serikat kaget setelah virus Corona SARS-CoV-2 yang mereka alami lebih mematikan daripada yang dialami China.

Hingga Selasa (21/4/2020), SARS-CoV-2 sudah menginfeksi 2.481.287 orang dan merenggut nyawa 170.436 orang, di mana lebih setengah korban berasal dari Eropa dan Amerika.

China hanya mencatatkan 82.758 kasus Covid-19 di mana 4.632 orang meninggal.

Bandungkan dengan Amerika Serikat yang mencatatkan 792.938 kasus Covid-19 dengan kematian 42.518 orang.

Atau Spanyol yang mencatatkan 200.210 kasus Covid-19 dengan angka kematian 20.852 orang, atau Italia yang mencatatkan 181.228 kasus Covid-19 di mana 24.114 orang meninggal.

Penelitian terbaru yang dilakukan ilmuwan terkemuka China mengungkap virus Corona SARS-CoV-2 punya kemampuan bermutasi hingga lebih mematikan dari yang pertama kali ditemukan di Wuhan China.

Profesor Li Lanjuan dan tim dari Universitas Zhejiang menemukan mutasi strain SARS-CoV-2 dalam sekelompok kecil pasien yang sebelumnya tidak dilaporkan.

Mutasi ini sangat langka sehingga para ilmuwan tidak pernah menganggapnya mungkin terjadi.

Mereka juga mengkonfirmasi untuk pertama kalinya dengan bukti laboratorium bahwa mutasi tertentu dapat membuat strain lebih mematikan daripada yang lain.

"Sars-CoV-2 telah memperoleh mutasi yang mampu secara substansial mengubah patogenisitasnya," tulis Li dan tim dalam makalah non-peer-review yang dirilis situs makalah medRxiv.org pada Minggu (19/4/2020).

Melansir South China Morning Post, penelitian Li memberikan bukti kuat pertama bahwa mutasi dapat mempengaruhi seberapa parah virus menyebabkan penyakit atau kerusakan pada inangnya.

Li mengambil pendekatan yang tidak biasa untuk menyelidiki mutasi virus.

Dia menganalisis strain virus yang diisolasi dari 11 pasien Covid-19 yang dipilih secara acak dari Hangzhou, Provinsi Zhejiang, dan kemudian menguji seberapa efisien mereka dapat menginfeksi dan membunuh sel.

Mutasi paling mematikan pada pasien Zhejiang juga telah ditemukan pada sebagian besar pasien di seluruh Eropa, sedangkan strain yang lebih ringan adalah varietas dominan yang ditemukan di bagian Amerika Serikat, seperti negara bagian Washington.

Penelitian terpisah menemukan bahwa strain New York diimpor dari Eropa. Tingkat kematian di New York serupa dengan di banyak negara Eropa, jika tidak lebih buruk.

Tetapi mutasi yang lebih lemah tidak berarti risiko yang lebih rendah untuk semua orang, menurut penelitian Li.

Di Zhejiang, dua pasien berusia 30-an dan 50-an yang tertular strain yang lebih lemah tapi mengalami sakit parah.

Meskipun keduanya bertahan dan sembuh, pasien yang lebih tua membutuhkan perawatan di unit perawatan intensif/ICU.

Temuan ini bisa menjelaskan perbedaan dalam mortalitas regional. Infeksi pandemi dan tingkat kematian bervariasi dari satu negara ke negara lain, dan banyak penjelasan telah diajukan.

Para ilmuwan genetika telah memperhatikan bahwa turunan dominan di wilayah geografis yang berbeda pada dasarnya berbeda.

Beberapa peneliti mencurigai perbedaan angka kematian dapat, sebagian, disebabkan oleh mutasi tetapi mereka tidak memiliki bukti langsung.

Masalah ini semakin rumit karena tingkat kesembuhan tergantung banyak faktor, seperti usia, kondisi kesehatan yang mendasarinya atau bahkan golongan darah.

Di rumah sakit, Covid-19 telah diperlakukan sebagai satu penyakit dan pasien telah menerima pengobatan yang sama terlepas dari strain yang mereka miliki.

Li dan koleganya menyarankan bahwa mendefinisikan mutasi di suatu wilayah mungkin menentukan tindakan untuk melawan virus.

“Pengembangan obat-obatan dan vaksin, walaupun mendesak, perlu memperhitungkan dampak akumulasi mutasi ini ... untuk menghindari kegagalan,” kata mereka.

Li adalah ilmuwan pertama yang mengusulkan penutupan Wuhan, menurut laporan media pemerintah.

Pemerintah mengikuti sarannya dan pada akhir Januari, kota dengan lebih dari 11 juta penduduk ditutup dalam semalam.

Ukuran sampel dalam penelitian terbaru ini sangat kecil.

Studi lain yang melacak mutasi virus biasanya melibatkan ratusan, atau bahkan ribuan strain.

Tim Li mendeteksi lebih dari 30 mutasi.

Di antara mereka 19 mutasi - atau sekitar 60 persen - adalah baru.

Mereka menemukan beberapa mutasi ini dapat menyebabkan perubahan fungsional pada protein lonjakan virus, struktur unik di atas selubung virus yang memungkinkan coronavirus mengikat dengan sel manusia. Simulasi komputer memperkirakan bahwa mutasi ini akan meningkatkan infektivitasnya.

Untuk memverifikasi teorinya, Li dan rekannya menginfeksi sel dengan strain yang membawa mutasi berbeda.

Jenis yang paling agresif dapat menghasilkan viral load 270 kali lebih banyak dibandingkan jenis yang paling lemah. Strain ini juga membunuh sel-sel tercepat.

Itu adalah hasil yang tak terduga dari kurang dari selusin pasien, "menunjukkan bahwa keragaman sebenarnya dari strain virus sebagian besar masih kurang diperhitungkan," tulis Li.

Mutasi adalah gen yang berbeda dari strain paling awal yang diisolasi di Wuhan, tempat virus pertama kali terdeteksi pada akhir Desember tahun lalu.

Virus Corona berubah dengan kecepatan rata-rata sekitar satu mutasi per bulan.

Hingga Senin (20/4/2020), lebih dari 10.000 strain telah diurutkan oleh para ilmuwan di seluruh dunia, yang mengandung lebih dari 4.300 mutasi, menurut Pusat Informasi Bio Nasional China.

Sebagian besar sampel ini, diurutkan dengan pendekatan standar yang dapat menghasilkan hasil dengan cepat. Gen diamati hanya sekali hingga ada ruang untuk kesalahan.

Tim Li menggunakan metode yang lebih canggih yang dikenal sebagai sekuensing ultra-dalam. Setiap blok pembangun genom virus dibaca lebih dari 100 kali, memungkinkan para peneliti untuk melihat perubahan yang bisa diabaikan oleh pendekatan konvensional.

Para peneliti juga menemukan tiga perubahan berturut-turut - yang dikenal sebagai mutasi tri-nukleotida - pada pasien berusia 60 tahun, yang merupakan peristiwa langka.

Biasanya gen bermutasi pada satu situs pada suatu waktu. Pasien ini menghabiskan lebih dari 50 hari di rumah sakit, lebih lama dari pasien Covid-19 lainnya, dan bahkan kotorannya menular dengan strain virus yang hidup.

"Menyelidiki dampak fungsional dari mutasi tri-nukleotida ini akan sangat menarik," kata Li dan tim.

Profesor Zhang Xuegong, kepala divisi bioinformatika di Laboratorium Nasional untuk Sains dan Teknologi Informasi di Universitas Tsinghua, mengatakan pengurutan ultra dalam dapat menjadi strategi yang efektif untuk melacak mutasi virus.

"Itu bisa menghasilkan beberapa informasi yang bermanfaat," katanya.

Tetapi pendekatan ini bisa jadi lebih memakan waktu dan mahal. Itu tidak mungkin diterapkan pada semua sampel.

"Pemahaman kami tentang virus tetap sangat dangkal," kata Zhang.

Pertanyaan seperti dari mana virus itu berasal, mengapa virus itu dapat membunuh beberapa orang muda yang sehat sementara tidak menghasilkan gejala yang terdeteksi di banyak orang lain masih membuat para ilmuwan menggaruk-garuk kepala mereka.

"Jika ada penemuan yang membalikkan persepsi yang ada, jangan kaget." (scmp)